气相色谱仪是以气体作为流动相(载气)，当气样进入汽化室后，被载气携带进入填充色谱柱。

由于样品中各组份在色谱柱中的流动相(气相)和固定相(液相或固相)间吸附力或溶解度的差异(即保留作用不同)。

在载气的冲洗下，各组份在两相间作反复多次分配并在柱中得到分离，随后顺序通过柱后检测器依次被检测出来，并转换为电信号送至色谱数据处理系统绘制色谱图给出定量、定性分析结果。